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온라인 안심존 데이터 ?

온라인 안심존 : 보안이 보장된 온라인 네트워크를 통해 집, 연구실, 사무실 등 어디서나 접속하여 데이터에 접근하고 분석

입니다.
#의료산업 # 의료 영상 인식 # 의료빅데이터 # 지능형 의료서비스 # 내시경 데이터셋 # CT 데이터셋 # PET-CT 데이터셋 # 의료 영상데이터 # 어노테이션 정보

위암 진단 의료 영상

위암 진단 의료 영상
  • 분야헬스케어
  • 구분 안심존(온라인)
  • 유형 비디오 , 이미지
구축년도 : 2020 갱신년월 : 2021-06 조회수 : 15,797 다운로드 : 44

※ 내국인만 데이터 신청이 가능합니다.

  • 데이터 변경이력

    데이터 변경이력
    버전 일자 변경내용 비고
    1.0 2021-06-30 데이터 최초 개방

    소개

    위암 진단 및 치료 과정에서 필요한 영상·이미지 데이터

    구축목적

    위암의 진단 및 병기 판단에 활용될 수 있도록 인공지능을 훈련하기 위한 데이터셋
  • 구축 내용 및 제공 데이터량

    • 원천데이터 11만 장 (위암 내시경 2만 장, 위암 CT 2만 장, 위암 PET-CT 7만 장) 추출
    • 내시경 사진 레이블링은 암 조직에 시행하며 그 이외의 정상 부위 또는 암이 아닌 양성종양 부위는 정상 부위로 판단
    • 데이터 구성은 환자 EMR 데이터, 어노테이션 데이터, 내시경, CT, PET-CT는 DICOM 형식
    데이터 구성 표
    데이터 종료 데이터 형태 목표 수량
    위암 내시경 DICOM 이미지 20,000 장
    위암 CT DICOM 이미지 20,000 장
    위암 PET-CT DICOM 이미지 70,000 장
    총계 11만 장
  • 저작도구 설명서 및 저작도구 다운로드

    저작도구 설명서 다운로드 저작도구 다운로드
  • AI 모델 상세 설명서 다운로드

    AI 모델 다운로드
  • 데이터 성능 점수

    측정값 (%)
    기준값 (%)

    데이터 성능 지표

    데이터 성능 지표
    번호 측정항목 AI TASK 학습모델 지표명 기준값 점수 측정값 점수
    1 위암 구분 정확도 Image Classification ResNet Accuracy 70 % 75 %
    2 위암 검출 정확도 Object Detection CNN, YOLO v5 F1-Score 0.8 0.82
    3 위암 검출 정확도 Object Detection CNN, YOLO v5 Specificity 70 % 78 %

    ※ 데이터 성능 지표가 여러 개일 경우 각 항목을 클릭하면 해당 지표의 값이 그래프에 표기됩니다.

    ※ AI모델 평가 지표에 따라 측정값의 범위, 판단 기준이 달라질 수 있습니다. (ex. 오류율의 경우, 낮을수록 좋은 성능을 내는 것으로 평가됩니다)

  • 설명서 및 활용가이드 다운로드

    데이터 설명서 다운로드 구축활용가이드 다운로드

    데이터 변경이력

    데이터 변경이력
    버전 일자 변경내용 비고
    1.0 2021.06.30 데이터 최초 개방  

    구축 목적

    • 위암의 진단 및 병기 판단에 활용될 수 있도록 인공지능을 훈련하기 위한 데이터셋

    활용 분야

    • 내시경, CT, PET-CT 세종류가 소화기계 암 진단에 중요한 정보로서 세종류가 위암의 진단 및 병기 판단에 활용됨. 내시경과 CT는 진단과 병기 설정을 위해, PET-CT는 전이 여부 판단 및 타 장기 암 진단에 활용

    소개

    • 가톨릭성모병원 EMR, PACS 시스템으로부터 추출 정제된 내시경, CT, PET-CT 의료 영상 데이터를 구축하고 AI 응용서비스를 고려한  EMR 데이터 항목(나이, 성별, 병리소견 등)을 포함하는 AI 데이터셋으로 데이터의 활용성 극대화를 추구하며, IRB(생명윤리위원회) 승인을 득한 원천 및 학습 데이터를 확보

       

    위암 진단 의료 영상-소개 이미지

    구축 내용 및 제공 데이터량

    • 원천데이터 11만 장 (위암 내시경 2만 장, 위암 CT 2만 장, 위암 PET-CT 7만 장) 추출
    • 내시경 사진 레이블링은 암 조직에 시행하며 그 이외의 정상 부위 또는 암이 아닌 양성종양 부위는 정상 부위로 판단
    • 데이터 구성은 환자 EMR 데이터, 어노테이션 데이터, 내시경, CT, PET-CT는 DICOM 형식
    데이터 구성 표
    데이터 종료 데이터 형태 목표 수량
    위암 내시경 DICOM 이미지 20,000 장
    위암 CT DICOM 이미지 20,000 장
    위암 PET-CT DICOM 이미지 70,000 장
    총계 11만 장

    대표도면

    위암 진단 의료 영상-대표도면-1

     

    필요성

    • 위암은 전 세계적으로 다섯 번째 다빈도 악성종양이며 암 관련 사망 원인의 세 번째를 차지하고 있는 주요 암이며, 특히 우리나라는 전 세계적으로 단위 인구당 위암 발생률이 매우 높고 국내에서 발생하는 모든 암종 중에서도 두 번째 다빈도 암(남자: 2위, 여자: 3위)으로 나타남
    • 위암 관련 병기 및 생존을 예측하는 문제에 있어서는 더욱 다양하고 환자의 실질적인 상황을 반영할 수 있는 요인들을 찾아 적용하여 분석할 필요가 있음

    데이터 구조

    • 데이터 구성
      - 위암의 객체 인식 인공지능학습을 위한 데이터셋은 이미지와 객체의 라벨링 정보를 포함한 어노테이션 데이터셋으로 구성됨.
      (1) 이미지 데이터
         - 원본 데이터: 익명화(anonymization)된 DICOM 데이터
         - 레이블링용 전처리 가공 데이터셋
      (2) 어노테이션 데이터 : 레이블링이 된 정보를 포함한 JSON 형태의 데이터
      (3) 이미지 파일명과 어노테이션 데이터의 파일명은 일치시킴

       

      위암 진단 의료 영상-대표도면-2
    • 어노테이션 포맷
      (1) Bounding box, polygon으로 어노테이션된 데이터의 JSON 파일
      어노테이션 포맷 표
      tag attribute 설명
      person_id 환자_id 비식별화된 환자 id
      image_name name 전체 데이터 셋 내의 경로
      image_type jpg or DICOM 이미지 데이터 형식
      image_seq number 전체 이미지중 몇 번째
      image_count number 전체 이미지 수
      width number image 너비
      height number image 높이
      person_id 0~4 0 : 정상, 1~4 : 암 기수
      anotations category "cancer" or "normal"
      type polygon (CT/PET-CT) or bbox (내시경)
      polygon 포인트 좌표들
      bbox x,y,width,height 형식

       

      (2) JSON 파일 샘플위암 진단 의료 영상-어노테이션 포맷-Json 파일 샘플
  • 데이터셋 구축 담당자

    수행기관(주관) : 싸이버로지텍
    수행기관(주관)
    책임자명 전화번호 대표이메일 담당업무
    남호경 02-6350-2308 nhk0102@cyberlogitec.com · 데이터 구축 총괄 · 원천 데이터 추출, 정제 및 가공 · AI 모델 및 응용 서비스 개발
    수행기관(참여)
    수행기관(참여)
    기관명 담당업무
    가톨릭대학교 산학협력단 · 원천 데이터 제공, AI 학습 데이터 가공
    테스트웍스 · 저작도구 제공 및 수정
    엠서클 · 데이터 상시 품질관리 시스템 개발
    데이터 관련 문의처
    데이터 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    남호경(싸이버로지텍) 02-6350-2308 nhk0102@cyberlogitec.com
보건의료 데이터 개방 안내

보건의료 데이터는 온라인 및 오프라인 안심존을 통해 개방됩니다.

안심존이란 안심존 이용메뉴얼 안심존 이용신청
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    * 온라인 안심존 : 보안이 보장된 온라인 네트워크를 통해 집, 연구실, 사무실 등 어디서나 접속하여 데이터에 접근하고 분석
    * 오프라인 안심존 : 추가적인 보안이 필요한 데이터를 대상으로 지정된 물리적 공간에서만 접속하여 데이터에 접근하고 분석

    1. AI 허브 접속
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    2. 안심존
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  • 1. 기관생명윤리위원회(IRB) 심의 결과 통지서 [IRB 알아보기]
    2. 기관생명윤리위원회(IRB) 승인된 연구계획서
    3. 신청자 소속 증빙 서류 (재직증명서, 재학증명서, 근로계약서 등 택1)
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    5. 보안서약서 [다운로드]
    ※ 상기 신청서 및 첨부 서류를 완비한 후 신청을 진행하셔야 정상적으로 절차가 이루어집니다.

  • 신청 및 이용관련 문의는 safezone1@aihub.kr 또는 02-525-7708, 7709로 문의

데이터셋 다운로드 승인이 완료 된 후 API 다운로드 서비스를 이용하실 수 있습니다.

API 다운로드 파일은 분할 압축되어 다운로드 됩니다. 분할 압축 해제를 위해서는 분할 압축 파일들의 병합이 필요하며 리눅스 명령어 사용이 필요합니다.

리눅스 OS 계열에서 다운로드 받으시길 권장하며 윈도우에서 파일 다운로드 시 wsl(리눅스용 윈도우 하위 시스템) 설치가 필요합니다.

※ 파일 병합 리눅스 명령어

find "폴더경로" -name "파일명.zip.part*" -print0 | sort -zt'.' -k2V | xargs -0 cat > "파일명.zip"

- 해당 명령어 실행 시, 실행 경로 위치에 병합 압축 파일이 생성됩니다.

- 병합된 파일 용량이 0일 경우, 제대로 병합이 되지 않은 상태이니 "폴더경로"가 제대로 입력되었는지 확인 부탁드립니다.

※ 데이터셋 소개 페이지에서 다운로드 버튼 클릭하여 승인이 필요합니다.