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온라인 안심존 데이터 ?

온라인 안심존 : 보안이 보장된 온라인 네트워크를 통해 집, 연구실, 사무실 등 어디서나 접속하여 데이터에 접근하고 분석

입니다.
#의료데이터 # 배아데이터 # 헬스케어 # 의료/헬스케어 #헬스케어 의료

NEW 난임시술 배아이미지 데이터

난임시술 배아 이미지 데이터 아이콘 이미지
  • 분야헬스케어
  • 구분 안심존(온라인)
  • 유형 이미지
구축년도 : 2022 갱신년월 : 2023-12 조회수 : 2,106 다운로드 : 5

※ 내국인만 데이터 신청이 가능합니다.

  • 데이터 변경이력

    데이터 변경이력
    버전 일자 변경내용 비고
    1.1 2023-12-29 데이터 최종 개방
    1.0 2023-04-30 데이터 개방(Beta Verison)

    데이터 히스토리

    데이터 히스토리
    일자 변경내용 비고
    2024-02-27 산출물 전체 공개

    소개

    난임 환자의 체외수정 과정을 통해서 얻어지는 데이터로써, 정자와 난자를 수정시킨 배아를 배양하고 특정 시점에 촬영한 데이터

    구축목적

    난임시술의 성공률을 높이기 위해서 질 좋은 배아를 선택하는 AI 모델을 만들어 제공하기 위함
  • ● 데이터 구축 규모

    과제번호 과제명 데이터 유형 데이터 설명 데이터 건수
    27 배아 이미지 데이터 원천데이터(PNG,JPG) 원본이미지 14,989
    라벨링데이터(JSON) labels 14,989
    meta 14,989
    메타데이터(JSON) 임상정보 8,559

     

    ● 데이터 분포
      - 다양성(통계)

    항목명 속성명 비율
    산모 연령대별 분포 0~10 0.02%
    10~20 0.02%
    20~30 6.46%
    30~40 77.63%
    40~50 15.75%
    기타 0.22%
    임신 여부 분포 임신 49.54%
    비임신 50.29%

      - 다양성(요건)

    항목명 속성명 비율
    현미경 이미지 배아 촬영 일자별 분포 3일 64.13%
    5일 35.87%
    타임랩스 이미지 배아 촬영 일자별 분포 3일 54.91%
    5일 45.09%
    배아 단계별 이미지 분포 1 3.81%
    2 9.40%
    3 17.63%
    4 27.41%
    5 23.67%
    6 18.07%

     

  • 저작도구 설명서 및 저작도구 다운로드

    저작도구 설명서 다운로드 저작도구 다운로드
  • AI 모델 상세 설명서 다운로드

    AI 모델 상세 설명서 다운로드 AI 모델 다운로드

    - Resnet은 이미지 인식을 위해 개발된 아키텍처로써 ImageNet에서 그 성능을 검증받음

      학습 (Training) 검증 (Validation) 시험 (Test)
    데이터 구축데이터 80% 구축데이터 10% 구축데이터 10%
    내용 학습 데이터는 많을수록 좋음 학습 중 모델 성능 평가 및 비교 최종 학습 된 모델의 성능 평가

     

    Train & Validation 구조와 Test 구조 설명 도식표

    서비스 활용 시나리오
    구축한 모델을 활용해 배아 선별이나 배아 추적 서비스에 활용할 수 있음

     

    1. 배아선별 서비스: 연구원들이 이식할 배아를 결정할 때 도움을 받을 수 있음 

    2. 배아추적 서비스: 배아를 배양하는 과정에서 각 배아를 개별 탐지함으로써 배아를 구분하여 추적할 수 있음 

  • 데이터 성능 점수

    측정값 (%)
    기준값 (%)

    데이터 성능 지표

    데이터 성능 지표
    번호 측정항목 AI TASK 학습모델 지표명 기준값 점수 측정값 점수
    1 배아 탐지 성능 Object Detection ResNet-50 + RetinaNet AP 80 % 83.09 %
    2 배아 등급 분류 성능 Image Classification ResNet-50 AUC-ROC 0.85 단위없음 0.853 단위없음
    3 임신 가능성 AI 분류 성능 Image Classification ResNet-50 AUC-ROC 0.65 단위없음 0.7 단위없음

    ※ 데이터 성능 지표가 여러 개일 경우 각 항목을 클릭하면 해당 지표의 값이 그래프에 표기됩니다.

    ※ AI모델 평가 지표에 따라 측정값의 범위, 판단 기준이 달라질 수 있습니다. (ex. 오류율의 경우, 낮을수록 좋은 성능을 내는 것으로 평가됩니다)

  • 설명서 및 활용가이드 다운로드

    데이터 설명서 다운로드 구축활용가이드 다운로드

    ● 난임시술 배아이미지 데이터
      - 원천데이터 (PNG)

    배아 이미지


      - 라벨링데이터 (JSON)
       ① labels

    배아 이미지 라벨링 데이터 스크린샷 이미지


       ②  meta

    메타 라벨링 데이터 스크린샷 이미지


    ● 전자 의료 기록 데이터
      - 환자의 임상정보

    환자 임상 정보 데이터 스크린샷 이미지


    ● 어노테이션 포맷
      - 라벨링 데이터 (meta)

    NO. 속성명 타입 필수여부 설명 범위 비고
      1-1 data_key string Y 데이터 경로    
      1-2 dataset string Y 작업 세트    
      1-3 image_info object Y 이미지 정보    
      1-4 width number Y 이미지 너비    
      1-5 height number Y 이미지 높이    
      1-6 label_id string Y 라벨링 파일 이름    
      1-7 label_path array Y 라벨링 파일 경로    
      1-8 last_updated_date string   마지막 수정 일자    
      1-9 tags array   이미지와 관련된 정보    
      1-10 id string   이미지 정보의 키값    
      1-11 name string   이미지 정보의 실제 값    
      1-12 work_assignee string   작업 할당 정보    
      1-13 status string   작업 상태    


      - 라벨링 데이터 (labels)

    No. 항목명 타입 필수여부 설명 범위 비고
    1 objects object Y 데이터셋 정보    
      1-1 id string Y 객체 아이디    
      1-2 class_id string Y 클래스 아이디    
      1-3 tracking_id int N 어노테이션 생성 번호    
      1-4 class_name string Y 클래스 명   zona_outer,zona_inner, TE, ICM, fertilized_egg, cell, fragmentation
      1-5 annotation_type string Y 어노테이션 형태   polygon, box
      1-6 annotation object N 어노테이션 정보    
      1-7 multiple boolean Y     true,false
      1-8 coord object Y 어노테이션 좌표    
      1-9 points object Y 어노테이션 실제 좌표값    
      1-10 meta object N 어노테이션 속성과 관련한 정보    
      1-11 z_index number N 어노테이션의 계층 (이번 배아 과제와는 상관없음)    
      1-12 visible boolean N 어노테이션 시각화 설정    
      1-13 alpha number N 어노테이션 투명도 설정    
      1-14 color string N 어노테이션 색상    
      1-15 properties list N 어노테이션의 속성    
      1-16 fertilized_egg_id number Y 수정란 아이디값    
      1-17 x number N 바운딩박스 x좌표    
      1-18 y number N 바운딩박스 y좌표    
      1-19 width number N 바운딩박스 길이    
      1-20 height number N 바운딩박스 높이    
      1-21 type string N      
      1-22 property_id string N 어노테이션 아이디값    
      1-23 property_name string Y 등급 속성    
      1-24 option_id string N 등급 아이디값    
      1-25 option_name string Y 등급    
      1-26 cell_count number Y 셀 수    
      1-27 cell_circumference array Y cell 둘레    
      1-28 zona_inner_area number Y zonna_inner 면적    
      1-29 framentation_area number N fragmentation 면적    
      1-30 fragmentation_percentage number N Cell 면적 대비 fragmentation 면적 비율    
      1-31 categories object N fertilized egg 값    
      1-32 properties array N Grade 등급 값    


      - 메타 데이터 (임상정보)

    NO. 항목명 타입 필수여부 설명 비고
    1 Patient.ID string Y 환자번호  
    2 Embryo.ET date string Y 배아 이식 일자  
    3 Embryo.OPU date string Y 난자 채취 일자  
    4 Patient.Femaleage string Y 여성 나이   
    5 Patient.Maleage string N 남성 나이  
    6 Patient.Cause string N 난임 원인 난임 원인
     
    남성 요인: 1
    배란기능장애: 2
    난소기능 저하: 3
    난관요인: 4
    자궁요인: 5
    자궁내막증: 6
    원인불명: 7
    복합요인 (2개 이상이 원인인 경우): 8
    기타요인: 9
    7 Cycle.G-sac string Y 아기 집 ex) 1,2 (아기집 개수)
    8 Cycle.Egg no string Y 총 난자 수  
    9 Cycle.Mll no string Y 성숙된 난자 수  
    10 Cycle.2PN no string Y 수정된 난자 수  
    11 Cycle.ET no string Y 이식한 배아 수  
    12 Cycle.Camera string Y 촬영 카메라  
    13 Cycle.Microscope string Y 촬영 현미경  
    14 stop character string Y 항목의 끝  
  • 데이터셋 구축 담당자

    수행기관(주관) : 아주대학교 산학협력단
    수행기관(주관)
    책임자명 전화번호 대표이메일 담당업무
    김미란 031-219-5300 kmr5300@ajou.ac.kr 데이터 확보, 추출, 검증, 인공지능 모델 개발과 검증, 홍보 활동 등 전 단계 관리 감독
    수행기관(참여)
    수행기관(참여)
    기관명 담당업무
    슈퍼브에이아이 이미지 데이터 정제 및 라벨링 도구 개발 및 교육, 크라우드 워커 관리, 데이터 관리
    카이헬스 총괄보조 및 진도관리, 인공지능 모델 개발, 모델 학습 및 검증, 데이터품질관리
    피트케어 데이터 전처리 및 1차 정제, S/W도구 개발
    데이터 관련 문의처
    데이터 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    김미란 031-219-5300 kmr5300@ajou.ac.kr
보건의료 데이터 개방 안내

보건의료 데이터는 온라인 및 오프라인 안심존을 통해 개방됩니다.

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    * 오프라인 안심존 : 추가적인 보안이 필요한 데이터를 대상으로 지정된 물리적 공간에서만 접속하여 데이터에 접근하고 분석

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  • 1. 기관생명윤리위원회(IRB) 심의 결과 통지서 [IRB 알아보기]
    2. 기관생명윤리위원회(IRB) 승인된 연구계획서
    3. 신청자 소속 증빙 서류 (재직증명서, 재학증명서, 근로계약서 등 택1)
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    5. 보안서약서 [다운로드]
    ※ 상기 신청서 및 첨부 서류를 완비한 후 신청을 진행하셔야 정상적으로 절차가 이루어집니다.

  • 신청 및 이용관련 문의는 safezone1@aihub.kr 또는 02-525-7708, 7709로 문의

데이터셋 다운로드 승인이 완료 된 후 API 다운로드 서비스를 이용하실 수 있습니다.

API 다운로드 파일은 분할 압축되어 다운로드 됩니다. 분할 압축 해제를 위해서는 분할 압축 파일들의 병합이 필요하며 리눅스 명령어 사용이 필요합니다.

리눅스 OS 계열에서 다운로드 받으시길 권장하며 윈도우에서 파일 다운로드 시 wsl(리눅스용 윈도우 하위 시스템) 설치가 필요합니다.

※ 파일 병합 리눅스 명령어

find "폴더경로" -name "파일명.zip.part*" -print0 | sort -zt'.' -k2V | xargs -0 cat > "파일명.zip"

- 해당 명령어 실행 시, 실행 경로 위치에 병합 압축 파일이 생성됩니다.

- 병합된 파일 용량이 0일 경우, 제대로 병합이 되지 않은 상태이니 "폴더경로"가 제대로 입력되었는지 확인 부탁드립니다.

※ 데이터셋 소개 페이지에서 다운로드 버튼 클릭하여 승인이 필요합니다.