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온라인 안심존 데이터 ?

온라인 안심존 : 보안이 보장된 온라인 네트워크를 통해 집, 연구실, 사무실 등 어디서나 접속하여 데이터에 접근하고 분석

입니다.
#헬스케어 의료

BETA 경추 CT 데이터

경추 CT 데이터 아이콘 이미지
  • 분야헬스케어
  • 구분 안심존(온라인)
  • 유형 이미지
구축년도 : 2023 갱신년월 : 2024-06 조회수 : 622 다운로드 : 4

※ 내국인만 데이터 신청이 가능합니다.

  • 데이터 변경이력

    데이터 변경이력
    버전 일자 변경내용 비고
    1.0 2024-06-28 데이터 개방 Beta Version

    데이터 히스토리

    데이터 히스토리
    일자 변경내용 비고
    2024-06-28 산출물 공개 Beta Version

    소개

    - 인공 디스크 치환술을 위한 bone segmentation 모델개발을 진행하기 위해 필요한 경추 CT 동영상으로부터 추출된 이미지에 라벨링 된 DICOM 데이터와 임상정보 데이터

    구축목적

    - 경추 인공디스크 치환술의 정확도 확보를 위한 경추 CT 데이터 구축
  • - 원천 데이터 

    1차 경로  2차 경로 3차 경로 4차 경로 파일 포맷 제출 수량
    사전 최종
    C N 환자 가명 ID 획득방향
    (SAG
    COR
    AXL
    RSA
    LSA)
    .dcm 7,984 2,979,625
    D
    F
    T
    I
    T N THN    4,339,369
    D
    F
    T
    I
    총 수량 7,934 7,318,994

     

    - 라벨링 데이터

    1차 경로  2차 경로 3차 경로 4차 경로 파일 포맷 제출 수량
    사전 최종
    C N 환자 가명 ID 획득방향
    (SAG)
    .json 1,251 112,405
    D 4,769 449,917
    F 714 46,286
    T 799 18,839
    I 401 6,900
    총 수량 7,934 634,347

     

    - 데이터 분포

    No. 분류 데이터 수 비율
    1 N 112,405 17.72%
    2 D 449,917 70.93%
    3 F 46,286 7.30%
    4 T 18,839 2.97%
    5 I 6,900 1.09%
  • 저작도구 설명서 및 저작도구 다운로드

    저작도구 설명서 다운로드 저작도구 다운로드
  • AI 모델 상세 설명서 다운로드

    AI 모델 상세 설명서 다운로드 AI 모델 다운로드

    - 경추체 영역 분할 모델
    ● 모델학습
       ● 입력 데이터는 Sagittal view의 경추 CT 영상과 경추체 영역 polygon data 를 사용
       ● 딥러닝에서 주로 의료 이미지 분할 및 세그멘테이션 작업에 사용되는 신경망 아키텍처 중 하나로 
           2015년에 영상 분할을 위해 처음으로 소개되었으며, 특히 의료 영상에서 부종, 종양, 기관 등을 세분화하는 작업에 많이 활용되고 있는 UNet 모델을 사용함.

    경추체 영역 분할 모델 UNet 이미지

     

    - 경추 질환 영역 검출 모델
    ● 모델학습
       ● 입력 데이터는 Sagittal view의 경추 CT 영상과 골극, 후종인대골화증, 추간공 협착증 영역에 대한 bounding box 좌표를 사용
       ● 객체의 클래스와 경계 상자를 동시에 예측 가능하며, 빠른 추론 속도와 높은 정확도를 가지는 YOLOv5 모델을 사용함

    경추 질환 영역 검출 모델 YOLOv5 이미지

     

    ● 서비스 활용 시나리오
       ● 자동 분할 및 측정
           - 딥러닝 모델을 사용하여 경추 CT 영상에서 경추체를 자동으로 분할함으로써 의료 전문가는 환자의 해부학적 특성을 빠르게 평가하는데 도움을 줌.
           - 경추체의 크기, 형태 및 위치와 같은 정보를 자동으로 추출하여 이를 기반으로 환자의 건강 상태를 평가하고 치료 계획을 수립할 수 있음.

       ● 진단 보조 도구
           - 딥러닝을 통한 자동 분할은 의료 전문가들에게 정확한 해부학적 정보를 제공하여 진단의 정확성을 향상시킬 수 있음.
           - 병변, 이상 소견, 혹은 진단적으로 중요한 특징들을 시각적으로 강조하고 확인하는 데 도움이 될 수 있음.

       ● 치료 계획과 감시
           - 경추 CT 영상을 기반으로 한 경추체 분할은 수술 전 치료 계획을 수립하거나 수술 중에 실시간 감시에 도움을 줄 수 있음.
           - 치료 후에는 환자의 회복 상태를 추적하고, 필요한 경우 추가 치료 계획을 수정하는 데 사용할 수 있음.

       ● 경추질환 탐지에 대한 자동화와 정확성 향상
           - 경추 질환을 치료하기 위해서는 인공 디스크 치환술이 필요하며, 이를 위해서는 경추 CT 이미지에서 질환 영역을 식별하고 분할하는 기술이 필요함
           - AI 기반으로 경추 CT 이미지에서 자동으로 질환 영역을 식별하고 분할하여 수동적인 진단 방법에 비해 시간과 비용을 절감하여 의료진의 효율성을 향상시킬 수 있음
           - 경추 질환 영역에 대해 위치와 크기를 정확하게 분석하여 전문가 수준의 정확성과 일관성을 제공

       ● 개인 맞춤형 치료 계획 수립
           - 다양한 질환 패턴을 탐지하고 분류하여 환자마다 다른 척추 모양과 크기, 질환을 탐지할 수 있음 
           - AI 기반의 경추 질환 탐지 모델을 통해 정확한 진단 결과를 얻어 개인에게 맞춤형 치료 계획 수립에 활용될 수 있음

  • 설명서 및 활용가이드 다운로드

    데이터 설명서 다운로드 구축활용가이드 다운로드

    - 데이터 구성

    Key Description Type
    annotation - array
    area 바운딩박스 크기 number
    vMax 바운딩박스 좌표값 object
    x 바운딩박스 시작점 x좌표 number
    y 바운딩박스 시작점 y좌표 number
    vMin 바운딩박스 좌표값 object
    x 바운딩박스 시작점 x좌표 number
    y 바운딩박스 시작점 y좌표 number
    width 바운딩박스 가로 길이 number
    height 바운딩박스 세로 길이 number
    label 라벨 string
    type 타입 string
    bbox_id 바운딩박스 식별ID number
    m_isClosed 폴리곤 개방여부 boolean
    m_area 폴리곤 크기 number
    m_points 폴리곤 객체 좌표 array
    x 폴리곤 n번째점 x좌표 number
    y 폴리곤 n번째점 y좌표 number
    polygon_id 폴리곤 식별ID number
    images 이미지 object
    width 이미지 가로크기 string
    dataCaptured 이미지 생성일자 string
    height 이미지 세로크기 string
    dataInfo 데이터카테고리 array
    slice_thickness  절편두께(mm) number
    slice_interval  절편간격(mm) number
    reconstruction  재구성 알고리즘/커널 number
    Series  획득방향 number
    Clinic_info 임상정보 object
    PatientID 식별ID 정보 string
    Age 나이 number
    Sex 성별 number
    Diagnosis 진단명 string
    Institution 기관 string
    Channel 채널 string

     

    - 어노테이션 포맷

    구분 속성명 타입 필수 여부 설명 범위
    1 annotation array    -   
    1-1 area number    바운딩박스 크기 123.123
    1-2 vMax object    바운딩박스 좌표값   
    1-2-1 x number    바운딩박스 시작점 x좌표 1
    1-2-2 y number    바운딩박스 시작점 y좌표 1
    1-3 vMin object    바운딩박스 좌표값   
    1-3-1 x number    바운딩박스 시작점 x좌표 1
    1-3-2 y number    바운딩박스 시작점 y좌표 1
    1-4 width number    바운딩박스 가로 길이 3
    1-5 height number    바운딩박스 세로 길이 3
    1-6 label string    라벨 C1
    1-7 type string    타입 rect
    1-8 bbox_id number    바운딩박스 식별ID   
    1-9 m_isClosed boolean    폴리곤 개방여부 true
    false
    1-10 m_area number    폴리곤 크기 123.123
    1-11 m_points array    폴리곤 객체 좌표   
    1-11-1 x number    폴리곤 n번째점 x좌표 1
    1-11-2 y number    폴리곤 n번째점 y좌표 1
    1-12 polygon_id nubmber    폴리곤 식별ID   
    2 images object y 이미지 -
    2-1 width string y 이미지 가로크기 512
    2-2 dataCaptured string y 이미지 생성일자 20200101
    2-3 height string y 이미지 세로크기 512
    3 dataInfo array    데이터카테고리   
    3-1 slice_thickness number     절편두께(mm) 1, 2, 3
    3-2 slice_interval number     절편간격(mm) 1, 2, 3
    3-3 reconstruction number     재구성 알고리즘/커널 0=Bone
    3-4 Series number    획득방향 1=sagittal  
    4 Clinic_info object y 임상정보  
    4-1 PatientID string y 식별ID 정보 100001
    4-2 Age number y 나이 40
    4-3 Sex number y 성별 1=남
    2=여
    4-4 Diagnosis string y 진단명 N
    D
    F
    T
    I
    4-5 Institution string y 기관 01=서울성모병원
    02=은평성모병원
    03=성빈센트병원
    04=분당차병원
    05=보라매병원
    06=고대안암병원
    4-6 Channel string y 채널 CH01=64
    CH02=128
    CH03=192
    CH04=16
    CH05=256

     

    - 데이터 포맷

    데이터 포맷 임상 데이터 : 텍스트
    영상 이미지 : DICOM
    임상 데이터 : 텍스트
    영상 이미지 : DICOM
    임상 데이터 : txt
    영상 이미지 : DICOM
    라벨링 : json
    *CSV,
    DCM
    json

     

    - 실제예시

    실제 예시 이미지

  • 데이터셋 구축 담당자

    수행기관(주관) : 가톨릭대학교 산학협력단
    수행기관(주관)
    책임자명 전화번호 대표이메일 담당업무
    정준용 02-2258-6254 jjdragon112@gmail.com 데이터 수집, 추출 및 정제, 가공 및 검수, 주관 행정
    수행기관(참여)
    수행기관(참여)
    기관명 담당업무
    ㈜미소정보기술 데이터 가공/검수, 저작도구 툴 제공
    (의료) 길의료재단 AI 모델 개발
    데이터 관련 문의처
    데이터 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    정준용 02-2258-6254 jjdragon112@gmail.com
    AI모델 관련 문의처
    AI모델 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    김광기 032-458-2879 kimkg@gachon.ac.kr
    저작도구 관련 문의처
    저작도구 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    박원형 02-2205-0552 pwh0928@misoinfo.co.kr
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    5. 보안서약서 [다운로드]
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API 다운로드 파일은 분할 압축되어 다운로드 됩니다. 분할 압축 해제를 위해서는 분할 압축 파일들의 병합이 필요하며 리눅스 명령어 사용이 필요합니다.

리눅스 OS 계열에서 다운로드 받으시길 권장하며 윈도우에서 파일 다운로드 시 wsl(리눅스용 윈도우 하위 시스템) 설치가 필요합니다.

※ 파일 병합 리눅스 명령어

find "폴더경로" -name "파일명.zip.part*" -print0 | sort -zt'.' -k2V | xargs -0 cat > "파일명.zip"

- 해당 명령어 실행 시, 실행 경로 위치에 병합 압축 파일이 생성됩니다.

- 병합된 파일 용량이 0일 경우, 제대로 병합이 되지 않은 상태이니 "폴더경로"가 제대로 입력되었는지 확인 부탁드립니다.

※ 데이터셋 소개 페이지에서 다운로드 버튼 클릭하여 승인이 필요합니다.